Departamenti për Integrim Evropian dhe Koordinim të Politikave ka për mision arritjen e pajtueshmërisë së politikave, planeve dhe strategjive në fushëveprimin e Ministrisë, në përputhje me politikat qeveritare dhe standardet e dokumentet strategjike të Bashkimit Evropian.
Detyrat dhe përgjegjësitë e Departamentit për Integrim Evropian dhe Koordinim të Politikave, janë:
Drejtori i Departamentit për Integrim Evropian dhe Koordinim të Politikave, raporton te Sekretari i Përgjithshëm.
Në kuadër të Departamentit bëjnë pjesë divizionet, si në vijim: