Zyrtari Certifikues ka për mision ndërmarrjen e veprimeve, për të siguruar që shpenzimi i parasë publike të bëhet në përputhje me legjislacionin në fuqi për financat publike.
Zyrtari certifikues në Ministri, vepron jashtë strukturave të Ministrisë dhe i raporton drejtpërdrejtë Sekretarit të Përgjithshëm.